Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO1Q147U7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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