Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF9Q13886 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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