Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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