Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms