Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN3Q13286 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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