Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX10Q13206 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX10Q13206 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms