Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
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