Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRPL28Q13084 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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