Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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RAB40BQ12829 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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RAB40BQ12829 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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RAB40BQ12829 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB40BQ12829 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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RAB40BQ12829 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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RAB40BQ12829 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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