Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNH2Q12809 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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