Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms