Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKL1Q00532 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms