Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNAQ00169 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms