Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAMQ00059 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAMQ00059 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms