Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAP3K9P80192 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms