Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms