Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms