Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS28P62857 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS28P62857 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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