Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms