Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL3P58215 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms