Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1S2P56377 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1S2P56377 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1S2P56377 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1S2P56377 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1S2P56377 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1S2P56377 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP1S2P56377 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms