Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD4P46934 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms