Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD52P43351 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms