Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP62P37198 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP62P37198 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP62P37198 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms