Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2IP36954 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms