Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT2P35908 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT2P35908 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT2P35908 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT2P35908 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT2P35908 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT2P35908 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms