Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTFRP26992 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms