Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLNP26678 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLNP26678 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLNP26678 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms