Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO1P25800 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms