Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRHP20396 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
TRHP20396 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRHP20396 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRHP20396 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRHP20396 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRHP20396 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRHP20396 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms