Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIG1P18858 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIG1P18858 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIG1P18858 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LIG1P18858 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIG1P18858 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIG1P18858 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIG1P18858 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIG1P18858 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIG1P18858 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIG1P18858 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIG1P18858 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIG1P18858 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIG1P18858 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms