Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGA2P17301 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms