Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms