Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms