Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A1P11836 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms