Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms