Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD1P0DJD0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms