Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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MSMBP08118 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSMBP08118 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSMBP08118 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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