Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEFLP07196 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEFLP07196 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms