Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGAVP06756 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms