Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3DP05423 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms