Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRB1P04280 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRB1P04280 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRB1P04280 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRB1P04280 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRB1P04280 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms