Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG12O94817 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG12O94817 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms