Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms