Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG13O75143 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG13O75143 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG13O75143 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG13O75143 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms