Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ABCC9O60706 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms