Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
EDIL3O43854 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EDIL3O43854 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms