Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSNA1O43805 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms