Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms