Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF1O43189 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF1O43189 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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